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1、加热方法：
加热时必须关闭冷媒进管阀门，放尽夹套内的剩余冷媒，再输入物料，开动搅拌器，然后开启蒸汽阀门，到达所需温度后，应先关闭蒸汽阀门，过2~3分钟后，再关搅拌器。
2、冷却方法：
关闭蒸汽阀门，放尽夹套剩余蒸汽冷凝水，再开缸底冷媒阀门，使冷媒从夹套通过，降低缸内物料的温度。
3、保温：
根据所需温度，开动搅拌器，高速阀门，并保持温度以便达到保温之目的。
4、清洗：
加工结束，放尽发酵罐缸内夹套剩余冷凝水后，应尽快用温水冲洗，刷掉粘糊着的物料，然后用40C~50C碱水在容器内壁全面清洗，并用清水冲洗，待下次使用时，用热水或蒸汽（90C）以上，保持2~3分钟的消毒处理。
粪便处理机操作方法
首先确认蒸汽发生器的各开关都处于正常状态，向发酵罐内加入水，将蒸汽发生器打开，然后检查发酵罐的各个开关是否都处于关闭状态。
清洗罐内，用自来水冲洗，并且取下pH电极，pH电极使用前要进行校正，校正用两种标准溶液，一种pH为4，另一种pH为6.86，校正方法与一般电极相同，校正完成后插上电极。
确认排料口已经关闭，向罐内注入6L的LB培养基，培养基的配方与种子培养时的培养基配方相同，然后旋紧加料口盖，打开搅拌，搅拌速度为200rpm。打开蒸汽发生器的蒸汽输出阀门，打开发酵罐的蒸汽通路总阀和排料口的蒸汽阀，排尽管路中残存的冷凝水，等出料口只有水蒸汽冒出时，就说明冷凝水排尽。
此时关闭排料口的蒸汽阀门，打开通入夹套中的蒸汽阀门，与排污阀，控制夹套中的压力，使其处于1.5MPa到2.0MPa左右，罐内的温度会迅速上升，等温度达到95℃时就可以关闭搅拌了。
此时罐内的培养基已经沸腾无需搅拌，混合的效果已经很好，同时要开始控制罐顶端的排气阀，先全开，以排尽罐内的空气，然后适当关小此阀，使罐内的压力略大于大气压。当温度达到121℃时，实罐灭菌开始计时，同时控制罐压和夹套内的压力，温度才能维持在121℃。
